IBM je komercijalizirao čitanje genoma

IBM je surađivao s proizvođačem medicinskih proizvoda Roche, izgraditi jeftin uređaj koji može čitati ljudske genome, objavila je u četvrtak tvrtka.

Iako tehnologija još uvijek može biti desetljeće ili više od komercijalizacije, jednom je trebala dati svakom liječniku jeftin i brz način "Ajay Royyuru, viši menadžer računalne biologije na IBM Researchu". "Trošak sekvencioniranja genoma je sišao, a brzina je počela poboljšavati, ali još uvijek postoje problemi s brzinom, ljestvicom, propusnost, kao i trošak ", rekao je Royyuru.

Projekt će koristiti IBM-ov" DNK tranzistor ". Ovi tranzistori sadrže nanopore, ili vrlo sitne pore, kroz koje se mogu izvoditi niti dezoksiribonukleinske kiseline (DNA). Nanopore identificira svaku bazu DNK pomoću električnog polja.

Budući da je nanopore dio dijela od silicija, ona bi trebala moći biti masovno proizvedena istim litografskim tehnikama koje se koriste za mikroprocesore čime se održava proizvodnja, dok su drugi istraživači istraživali upotrebu nanoporata, takvi dizajni ne mogu točno čitati DNK, jer DNK prebrzo putuje kroz pore.

"To je poput sisanja na špageti. počinje se kretati kroz nanopore, to je jako brzo, vidjeli smo 48.000 jedinica DNK u 10 ili 20 milisekundi, a ta brzina ima vrlo malo šanse da to točno pročita ", rekao je Royyuru. brzinu DNK, IBM je na nanoporu stvorio električnu kontrolu kako bi pričvrstio protok prema željenoj brzini. "Možemo elektricno kontrolirati DNK pokret kroz pore … možemo ga unaprijediti po jedinici", rekao je.

Iako su tehnologije sekvenciranja DNA od početka 1970-ih, cijeli ljudski genom nije dekodiran u cijelosti do 2001, zbog automata potrebnog za dekodiranje velikog broja osnovnih parova koje treba pročitati. DNK svake osobe sadrži oko 3 milijarde baza parova nukleotida.

Dok se tehnologija sekvencioniranja DNA poboljšava od tada, još uvijek košta nekoliko stotina tisuća dolara za čitanje čitavog ljudskog genoma, rekao je Royyuru. Nakon što je spreman, ovaj uređaj bi trebao biti u mogućnosti obavljati posao bilo gdje od 100 do 1000 dolara po čitanju, procjenjuje Royyuru. Royyuru nije želio ponuditi vrijeme kada će stroj biti komercijalno dostupan, navodeći mnoge korake potrebne za radikalno novu tehnologiju za proizvodnju. Procjenjuje se da će trebati oko pet do deset godina za završetak istraživanja.

Rocheova sekvencijska podružnica, 454 Life Sciences, u konačnici će tržište rezultirati proizvodima koji dolaze iz ove suradnje. IBM će prenijeti partnerstvu svoje stručnosti u izgradnji elektronike i upravljanja podacima, dok će Roche primjenjivati ​​svoje znanje u medicinskoj dijagnostici i sekvenciranju genoma, rekao je Royyuru.

Čitanje genetskog koda pojedinca moglo bi imati više medicinskih prednosti, objašnjava Royyuru. Posebno će to dopustiti liječnicima da "personaliziraju pružanje medicinske skrbi", kazao je. Na primjer, mnogi će lijekovi raditi na nekim, ali ne i svim ljudima. Imajući DNK osobe u ruku pomoći će liječniku propisati odgovarajuću medicinu. Također, čitanje genoma može otkriti osjetljivost na određene bolesti.

Možda je još jedna ranija upotreba mogla biti u određivanju koliko dugo pojedinci mogu živjeti. U četvrtak su istraživači iz Sveučilišta u Bostonu objavili da su pronašli ono što se čini genetskim potpisima dugovječnosti.

Joab Jackson pokriva softverski softver i opće tehnološke vijesti za

IDG News Service

. Slijedite Joab na cvrkut na @Joab_Jackson. Joabova adresa e-pošte je [email protected]